Моделирование биосинтеза хромофора зеленого флуоресцентного белка методами квантовой химии1 - shikardos.ru o_O
Главная
Поиск по ключевым словам:
страница 1
Похожие работы
Название работы Кол-во страниц Размер
Исследование структуры и свойств зеленого флуоресцентного белка с... 1 14.85kb.
Моделирование фотофизических свойств хромопротеина asFP595. 1 11.43kb.
Дополненная опытом 2013 года. Пояснение к технологической схеме производства... 1 30.06kb.
Трёхмерное Моделирование процессов взаимодействия лазерного излучения... 1 16.16kb.
Когнитивное функционирование и его динамика у больных терапевтически... 1 267.94kb.
1. Твое имя: викуша 2 Никнейм, прозвища? Ви-ви, викса, викушка, белка... 1 46.01kb.
Радзинский Э. Загадки истории. М, 2007. 480 с 1 74.27kb.
Учебное пособие Аннотация 4 1314.42kb.
Классный час «В гостях у зелёного друга» 1 122.7kb.
«Защита данных стенографическими методами» 1 322.63kb.
Программа вступительного экзамена в аспирантуру ики ран по специальности 05. 1 46.98kb.
3d рмгд код marple программное обеспечение для моделирования высокотемпературной... 1 25.34kb.
- 4 1234.94kb.
Моделирование биосинтеза хромофора зеленого флуоресцентного белка методами квантовой - страница №1/1

Моделирование биосинтеза хромофора зеленого флуоресцентного белка
методами квантовой химии1


Миронов Владимир Андреевич

Аспирант

Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова,

химический факультет, Москва, Россия

E–mail: vladimir.a.mironov@gmail.com

В настоящее время большое внимание уделяется флуоресцентным белкам, нашедшим широкое применение в клеточной биологии в качестве флуоресцентных маркеров [1

. ..Rev.Biochem.ent proteinимический методовциклизация и окислительная дегидратация.омофора белка тков.ения.ологии в качестве ]. Одним из преимуществ меток такого типа является то, что для флуоресценции им не требуются какие-либо кофакторы [2]. Оптические свойства таких белков обусловлены только присутствием в их строении особой хромофорной группы, образующейся в результате автокаталитической циклизации и последующего окисления молекулярным кислородом последовательности из трех аминокислотных остатков, расположенных в центре белка. Скорость протекания этой реакции, а также структура и спектральные характеристики зрелого хромофора в значительной мере зависят от его белкового окружения. Понимание процесса биосинтеза важно для направленного синтеза флуоресцентных белков с заданными свойствами. В настоящий момент известна лишь общая схема протекания данного процесса, детали его неизвестны.

Рисунок 1. Схема реакции образования хромофора белка EGFP.



Данная работа посвящена исследованию возможного пути протекания биосинтеза хромофора белка EGFP. С помощью современных методов вычислительной химии исследованы основные стадии данного процесса: циклизация и окислительная дегидратация2. Для последней стадии проанализированы различные пути данного процесса. Исследовано влияние остатков Arg96 и Glu222 на процесс протекания реакции. Показаны основные этапы стадии окисления: депротонирование прекурсора хромофора, перенос электрона на молекулу кислорода на ППЭ триплетного состояния, триплет-синглетный переход и образование продукта.

Литература

  1. Tsien, R.Y. The green fluorescent protein // Annu. Rev. Biochem. 1998, № 67, p. 509–544.

  2. Craggs, T.D. Green fluorescent protein: structure, folding and chromophore maturation // Chem. Soc. Rev. 2009, № 38, p. 2865–2875.

1 Данная работа поддержана грантом Президента Российской Федерации (MK-64815.2010.4).

2 Большая часть расчетов была выполнена с использованием ресурсов суперкомпьютерного комплекса СКИФ-МГУ «Чебышев».